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n.BA.AD.BiIn1.24HS (Bioinformatics 1)
Modul: Bioinformatics 1
Diese Information wurde generiert am: 23.11.2024
Nr.
n.BA.AD.BiIn1.24HS
Bezeichnung
Bioinformatics 1
Credits
2
Beschreibung
Version: 1.0 gültig ab 01.08.2024
Studiengang
Applied Digital Life Sciences
Geltende Rechtsordnung
RPO vom 29. Januar 2008, Studienordnung des Dept. N vom 15. Dez. 2009, Anhang für den Bachelorstudiengang Applied Digital Life Sciences
Modultyp
Pflichtmodul
X
Wahlpflichtmodul
Wahlmodul
Plansemester
5. Semester
Modulverantwortliche/r
Maria Anisimova
Telefon / E-Mail
+41 (0)58 934 58 82 /
maria.anisimova@zhaw.ch
Beteiligte Mitarbeitende und Lehrbeauftragte
Maria Anisimova
Manuel Gil
Tugçe Bilgin Sonay
Gastdozierende
Vorausgesetzte Module
-
Zu erreichende Kompetenzen
Fachliche Kompetenzen:
Die Studierenden können
die Konzepte und Algorithmen hinter den im Kurs vermittelten Methoden erklären.
die relativen Stärken und Schwächen der Methoden erläutern.
die Methoden auf Datensätzen anwenden.
die Konzepte und Methoden auf ihre individuellen Forschungsfragen anwenden.
Überfachliche Kompetenzen:
Die Studierenden können
rechnergestützte Methoden kritisch hinterfragen, auf echte molekulare Daten anwenden und ihre Ergebnisse interpretieren.
Inhalt des Moduls
Einführung in genomische Daten
Gendatenbanken: NCBI, Swissprot
Grundlegende Homologie: BLAST-Suchen, paarweises Alignment
Austauschmodelle: grundlegende Nukleotid- und Aminosäuremodelle
Mehrfachsequenzalignment: traditionelle Methoden und phylogenetisch bewusste Ansätze
Genbasierte Phylogenetik: Parsimonie-, Distanz- und Maximum-Likelihood-Methoden
Speziesbäume, Orthologie und Paralogie
Simulation der molekularen Sequenzevolution
Anschlussmodule
Bioinformatics 2
Unterrichtsmethoden
Kombination aus Vorlesungen und Übungen
Digitale Lernressourcen
Wissenschaftliche Artikel
Einführungstexte
Individuelle Buchkapitel
Übungsblätter (und Lösungen)
Unterrichtsgliederung / Gesamtaufwand
Kontaktstudium
28
Begleitetes Selbststudium
14
Autonomes Selbststudium
18
Total Workload
60
Präsenzverpflichtung im Unterricht
Präsenz wird stark empfohlen, aber nicht mit Präsenzliste durchgesetzt.
Leistungsnachweise
Abgesetzte mündliche Modulprüfung 100%
Unterrichtssprache
Englisch
Bemerkungen
-
Kurs: Bioinformatics 1
Nr.
n.BA.AD.BiIn1.24HS.V
Bezeichnung
Bioinformatics 1
Hinweis
Für das Stichdatum 23.11.2024 ist kein Modulbeschreibungstext im System verfügbar.